「d1」の検索結果

Identifies super-enhancers from H3K27ac, MED1, or BRD4 ChIP-seq using ROSE, ROSE2, LILY, HOMER -style super, and ENCODE dELS cross-referencing. Handles peak stitching parameters, ranking choices, hockey-stick inflection, marker choice (H3K27ac vs MED1/BRD4), and cross-condition comparison with spike-in normalization. Constructs core regulatory circuitry (Saint-Andre 2016) from SE-encoded TFs. Use when identifying cell-identity / cancer-associated regulatory domains, comparing super-enhancers between conditions, identifying master transcription factor networks, or predicting BET-inhibitor responsiveness.

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Hit the Cloudflare REST API directly for operations that wrangler and MCP can't handle well. Bulk DNS, custom hostnames, email routing, cache purge, WAF rules, redirect rules, zone settings, Worker routes, D1 cross-database queries, R2 bulk operations, KV bulk read/write, Vectorize queries, Queues, and fleet-wide resource audits. Produces curl commands or scripts. Triggers: 'cloudflare api', 'bulk dns', 'custom hostname', 'email routing', 'cache purge', 'waf rule', 'd1 query', 'r2 bucket', 'kv bulk', 'vectorize query', 'audit resources', 'fleet operation'.

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Skill for integrating Better Auth - comprehensive TypeScript authentication framework for Cloudflare D1, Next.js, Nuxt, and 15+ frameworks. Use when adding auth, encountering D1 adapter errors, or implementing OAuth/2FA/RBAC features.

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Expert knowledge for Drizzle ORM - the lightweight, type-safe SQL ORM for edge and serverlessUse when "drizzle, drizzle orm, drizzle-kit, drizzle schema, drizzle migration, drizzle relations, sql orm typescript, edge database, d1 database, orm, database, typescript, sql, edge, serverless, d1, postgres, mysql, sqlite" mentioned.

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Cloudflare Workers edge computing — Durable Objects, KV, R2, D1, Workers AI, AI Gateway

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Cloudflare platform management via Wrangler CLI, Agents SDK (v0.13+), and Browser Rendering API. Deploy Pages, Workers, KV, R2, D1, Queues, Vectorize, Workflows, Hyperdrive. Build stateful AI agents with the full SDK stack — Agent, AIChatAgent, Think, Voice, sub-agents, fibers, HITL, scheduling, observability, Code Mode (Dynamic Worker sandboxes). Budget web scraping via cf_browser.py. Use when deploying to Cloudflare, managing CF infrastructure, configuring wrangler.toml/wrangler.jsonc, building AI agents or chat agents on Workers, adding voice, orchestrating sub-agents, or for cheap web scraping. Triggers: Cloudflare, wrangler, Pages, KV, R2, D1, Workers, Vectorize, Queues, Workflows, Hyperdrive, cf_browser, Browser Rendering, Agents SDK, Code Mode, codemode, MCP, Think, AIChatAgent, Voice agent, sub-agents, fibers, HITL, Dynamic Workers.

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MANDATORY deploy after every code change. Typecheck → deploy → purge CDN → E2E on production → visual verify → fix-forward loop. Workers Builds native CI/CD, D1 Time Travel PIT recovery, D1→R2 long-term backups, wrangler rollback, wrangler secrets management, structured observability, cross-browser smoke tests, rollback procedures, and GitHub auto-configuration.

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Use when adding, reviewing, squashing, deploying, or rolling back Pharos D1 migrations or schema cleanup.

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Firmware development for the Arduino Nano (A000005, ATmega328P @ 16 MHz, 5 V) — its 30 KB usable flash, 2 KB SRAM, 1 KB EEPROM, 8-channel 10-bit ADC, six 8-bit PWM pins across three timers, UART shared with the USB-serial chip, I2C on A4/A5, SPI on D10–D13, sleep modes, and the Arduino AVR core + PlatformIO setup around them. Use when working on this board or any ATmega328P Nano clone (FTDI or CH340 USB): project setup, platformio.ini, old-vs-new bootloader uploads, pin mapping, A6/A7 restrictions, timer/Servo/tone conflicts, the 2 KB SRAM budget, analog references, powering from VIN, ICSP recovery, or debugging why something on the board does not work.

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PXE/netboot 経由で Debian + HW RAID10 を自動インストール (OpenWrt ローカル TFTP + embed ipxe.efi + IPv4 リテラル mirror)。BMC USB redirector が累積劣化した機種 (TX1320 M3 等) や、 cross-site 拠点の install に使う。phase 19 で training-tx1320 で完遂、 物理操作なしで自力 SSH まで到達。

Identifies super-enhancers from H3K27ac, MED1, or BRD4 ChIP-seq using ROSE, ROSE2, LILY, HOMER -style super, and ENCODE dELS cross-referencing. Handles peak stitching parameters, ranking choices, hockey-stick inflection, marker choice (H3K27ac vs MED1/BRD4), and cross-condition comparison with spike-in normalization. Constructs core regulatory circuitry (Saint-Andre 2016) from SE-encoded TFs. Use when identifying cell-identity / cancer-associated regulatory domains, comparing super-enhancers between conditions, identifying master transcription factor networks, or predicting BET-inhibitor responsiveness.

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Cloudflare WorkersのCI(自動検査)とCD(自動デプロイ)を、Workers Buildsまたは外部CI/CDから案件に合う1経路だけ選び、無料枠に収まる最小構成で構築・運用するためのスキル。 「CIを入れて」「CDを組んで」「自動デプロイしたい」「GitHub Actions」「ワークフロー」「テストを自動で回したい」 「マージしたら勝手に公開されるようにして」「デプロイを自動化して」「CIが落ちた」「Actionsが失敗する」 「デプロイの手作業をなくしたい」「Cloudflareの設定が分からない」「非エンジニア向け手順を作って」などの文脈で必ず使用する。 デプロイ先が Cloudflare Workers の場合は Skill cloudflare-secure-deploy を併用する(D1マイグレーションの扱いが最重要)。ブランチ・PR・タグの規約は Skill solo-git-flow に従う。手動デプロイを繰り返している状況を見つけたら、依頼されていなくても このスキルの §0 を読んで導入可否を判断すること。

Webアプリのアクセス制御・認証・認可の実装はすべてこのスキルを使う。遮断だけならCloudflare Access、アプリ内identity・role・session・WebSocket等が必要ならBetter Authとする単一決定表の正本。「認証を付けて」「ログイン機能」「Googleでログインできるように」「社員だけに限定」「特定企業だけに公開」「許可リスト/招待制」「メール+パスワード認証」「セッション管理」「ロール・権限管理」「OAuth設定」「redirect_uri_mismatchを直す」「認証のセキュリティレビュー」などの文脈で、ユーザーが「認証」と明示しなくてもログイン要件が含まれるなら必ず読む。特にNext.js App Router＋OpenNext＋D1、Hono、素のWorkersでのBetter Auth＋Google OAuth導入を自動化し、Google Cloud Consoleで人間にしかできない操作は日本語のクリック手順と直リンクへ切り分ける。

Cloudflare Workers CLIでWorkers、KV、R2、D1、Vectorize、Hyperdrive、Workers AI、Containers、Queues、Workflows、Pipelines、Secrets Storeを開発・デプロイ・管理する。Wranglerコマンドを実行する前に使用し、最新の公式ドキュメントに基づく構文と安全規則を確認する。

Cloudflare全体の製品選択と対象Accountの文脈を確定するルータースキル。Workers、Pages、KV、D1、R2、Workers AI、Vectorize、Agents SDK、Flagship、Tunnel、WAF、Terraform等のどの製品・参照・専用Skillを使うか判断する。Cloudflare要件が複数製品にまたがる、製品名が未確定、Accountの選択が必要な場合に使う。Wrangler操作、Durable Objects、Turnstile、Email Service、Workersコード、本番デプロイは責務表の専用Skillへ委譲し、本Skillで実行手順を重複定義しない。数値・API・設定は記憶よりCloudflare公式ドキュメントの取得を優先する。

機能一覧の新規作成・更新・レビューを支援する。ユースケース一覧をはじめとする D1.ビジネス要求成果物を「システムが提供する機能能力」へ翻訳する文書。ユースケース一覧の策定後、機能の洗い出し段階で呼び出す。

Manage Cloudflare DNS zones, Workers, Pages, R2, KV, D1, and analytics via REST API. Use when the user wants to query DNS, deploy a Worker, list R2 buckets, manage KV namespaces, run D1 queries, or check analytics without the Cloudflare MCP installed.

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Expert en Cloudflare avancé (Workers, Pages, R2, D1, Durable Objects, KV, WAF)

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Cloudflare Specialist IA — Expert en Cloudflare (Workers, Pages, DNS, WAF, R2, D1, Turnstile, Images)

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MANDATORY deploy after every code change. Typecheck → deploy → purge CDN → E2E on production → visual verify → fix-forward loop. Workers Builds native CI/CD, D1 Time Travel PIT recovery, D1→R2 long-term backups, wrangler rollback, wrangler secrets management, structured observability, cross-browser smoke tests, rollback procedures, and GitHub auto-configuration.

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Handles BED-format genomic intervals (BED3 through BED12, narrowPeak/broadPeak) and the coordinate-system substrate the whole interval category rests on, with bedtools (CLI) and pybedtools/pyranges/pandas (Python). Covers the 0-based half-open vs 1-based-closed convention boundary and the start-1/end-unchanged conversion, the silent failures (chrom-name mismatch, CRLF, lexicographic-vs-version sort under -sorted), genome/chrom.sizes generation, sorting contracts, BED12 block invariants, validation, makewindows, cross-assembly liftover (liftOver/CrossMap), and BED<->VCF/BAM/FASTA conversion. Use when reading, creating, validating, sorting, lifting between genome builds, or converting interval files, preparing inputs for bedtools/tabix/bigBed, or debugging an off-by-one or empty-overlap result.

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Designs custom laboratory hardware as parametric build123d models and exports fabrication artifacts as STEP, STL, and DXF files - microfluidic chips and molds, optomechanical mounts and breadboard adapters, cuvette and microplate holders, tube racks, animal-behavior rigs, and 3D-printed instrument fixtures. Use when a research task needs a physical part that must mate with standardized labware, an optical table, a cage system, or a printer, CNC, or laser process.

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Generate, regenerate, and validate 2D DXF drawings from Python build123d sources. Use for DXF files, `.py` drawing scripts, @dxf models, 2D profiles, outlines, templates, gaskets, panels, flat patterns, laser/plasma/waterjet cut layouts, and 2D drawing exports of CAD geometry. Open and visually review existing DXF files in CAD Viewer.

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