领域缩略语展开 Skill:按内置或外部词典将独立缩略语替换为全称,可选在全称后保留原缩写。 适用于技术文本、论文摘要和业务记录中的缩写清洗;不负责模糊缩写消歧或大小写无关替换。
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公共基础项枚举校验工具。读取被检验表和标准词典文件,将被检验表中的属性项值与标准词典进行比对, 检查是否超出词典规定的固有词表枚举值范围,超出范围的记录会标记质控标识并输出异常数据。当用户提到枚举校验、枚举值检查、属性项校验、词表校验等需求时使用此skill。
即使用户没有明确说出"枚举校验",只要任务涉及将被检验数据与标准词典进行比对,就应该使用此skill。
インストールする前に、エージェントに与えられる指示の中身を確認できます。
本skill用于将被检验表中的属性项值与相应标准词典进行比对,检查是否超出词典规定的固有词表枚举值范围。如果超出范围,会标记质控标识并输出异常数据。
当用户请求以下任务时,应使用此skill:
需要校验的数据文件,支持CSV、TSV、Excel、SPSS等格式。
标准词典文件,包含正确的枚举值列表。
向用户确认:
在 scripts/ 目录下找到 QC2_EnumerationFieldCheck.py,使用Python执行:
python scripts/QC2_EnumerationFieldCheck.py \
--origin_file_path <被检验表> \
--standard_file_path <标准词典> \
--error_output_path <异常数据输出> \
--origin_output_path <处理后数据输出> \
--comparison_field "<对比字段>" \
--qc_mark "<质控标识>" \
--mark_field_name <质控字段名> \
--id_field_name <ID字段名>
| 参数 | 必填 | 说明 |
|---|---|---|
--origin_file_path | 是 | 被检验数据文件路径 |
--standard_file_path | 是 | 标准词典文件路径 |
--error_output_path | 是 | 异常数据输出路径 |
--origin_output_path | 是 | 处理后原始数据输出路径 |
--comparison_field | 是 | 对比字段,格式:原字段1,原字段2:标准字段1,标准字段2 |
--qc_mark | 是 | 质控标识(如QC2_ERROR) |
--mark_field_name | 否 | 质控标识字段名,默认QC0000 |
--id_field_name | 否 | 唯一ID字段名,默认ID0000 |
[OK] Using encoding GB2312 successfully read CSV file
Successfully read file: /path/to/origin.csv, shape: (1000, 18)
Successfully read file: /path/to/standard.csv, shape: (50, 2)
########## Exception: Enumeration value out of range!!!
Abnormal data (first 10 rows):
...
Enumeration check completed, output files generated!
[OK] Using encoding GB2312 successfully read CSV file
Successfully read file: /path/to/origin.csv, shape: (1000, 18)
Successfully read file: /path/to/standard.csv, shape: (50, 2)
Enumeration check completed, output files generated!
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概要と使いどころ
领域缩略语展开 Skill:按内置或外部词典将独立缩略语替换为全称,可选在全称后保留原缩写。 适用于技术文本、论文摘要和业务记录中的缩写清洗;不负责模糊缩写消歧或大小写无关替换。
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字母数字比例过滤器。过滤文本中字母/数字比例不在指定范围内的样本。 当用户提到文本过滤、比例筛选、字母比例、数字比例、清理乱码文本等需求时使用此skill。 即使用户没有明确说出"过滤",只要任务涉及根据文本中字母或数字的比例来筛选数据, 就应该使用此skill。
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平均行长度过滤器。过滤文本平均行长度不在指定范围内的样本。 当用户提到行长度过滤、平均行长度、文本行长度筛选、按行筛选等需求时使用此skill。 即使用户没有明确说出"平均行长度",只要任务涉及根据文本中每行的平均长度来筛选数据, 就应该使用此skill。
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批量文件清单采集器。扫描一个或多个本地文件/目录,或从任务列表加载路径, 按支持的扩展名生成文件元信息清单,供后续文本、表格、文档、图像等采集流程继续处理。 当用户需要批量盘点待采集文件、生成本地文件 manifest、统计输入文件类型或为后续采集算子准备文件清单时使用此 skill。
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批量数据均匀分片工具。读取json/jsonl/csv输入,按份数或固定条数切成多个子文件,输出一个清单JSON供下游节点消费。 当用户提到数据分割、批量拆分、数据分片、均匀分块等需求时使用此skill。 即使用户没有明确说出"分片",只要任务是把整份批量数据均匀拆成多个文件,就应该使用此skill。 不负责按字段分组导出或随机采样。
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本skill是用于单细胞测序数据分析的专用技能,首先需要用户上传需要处理的单细胞测序数据,再对经过预处理的单细胞表达数据进行自动化细胞类型注释。它通过基因比对、数据标准化、降维等一系列流程,将细胞聚类结果与已知参考数据库进行匹配,从而为每个细胞分配生物学功能标签。
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